L’équipe de Jiraiya, composé de Yahiko, Nagato et Konan

C’était en temps de guerre, beaucoup de ninjas sont tombés durant cette terrible bataille opposant le Village de Konoha à celui de la Pluie. Jiraiya ainsi que ses deux compagnons de l’époque Orochimaru et Tsunade faisaient partie des derniers survivants. Et c’est à ce moment-là que Jiraya rencontra ses prochains élèves. Un jeune garçon orphelin du nom de Yahiko demanda aux trois Sannins un peu de nourriture, que Jiraya lui donna. Yahiko appela ses deux amis également orphelins (leurs familles ont été massacrées par les ninjas ennemis…)… Les trois enfants suivirent les Sannins afin de leur demander de leur enseigner le Ninjutsu. Orochimaru voulait se débarrasser des trois jeunes enfants, car il prétendait que leur avenir serait très difficile, et qu’il serait mieux pour eux de les éliminer. Jiraiya refusa son offre, et décida de rester au Village de la Pluie pour les entraîner. Comme les familles des trois orphelins furent massacrées par des ninjas de Konoha durant cette guerre, Jiraya se sentant responsable de cela, c’était pour lui la moindre des choses que de leur enseigner l’art du Ninjutsu. Après cet événement, une nouvelle équipe s’est formée, composé de :

Nom : Jiraiya
Un des trois légendaires Sannins de Konoha (à l’époque il était moins connu qu’aujourd’hui).

Nom : Yahiko
Un jeune garçon très dynamique, qui a pour but de devenir plus fort afin de protéger les personnes qui lui sont chères, ainsi que sa patrie.

Nom : Nagato
Héritier du légendaire Rinnegan, le Doujutsu le plus puissant qui soit. Nagato est le plus fort du groupe, c’est également un enfant sensible et très mystérieux. Il est prêt à tout pour protéger ses amis.

Nom : Konan
Une jeune fille experte en Origami, elle est la plus gentille et la plus calme du groupe.

Pour protéger son ami, Nagato terrassa un ninja du Village de la Roche qui les attaqua, en éveillant son Rinnegan. Le soir même, Nagato se confia à Jiraiya : il lui expliqua qu’il ne voulait pas tuer ce ninja, et qu’il l’avait fait insconsciemment, comme dans un état second. Le lendemain, Jiraiya et les trois futurs ninjas de la Pluie commencèrent l’entraînement… Au cours de cet entraînement qui dura trois ans, Nagato maîtrisa toutes les techniques que Jiraiya lui enseigna, ainsi que les six formes de Chakra…

Au bout des trois ans, Jiraya leur avait enseigné assez de techniques pour qu’ils puissent se défendre contre d’éventuels ennemis. C’est également grâce à Jiraiya que Nagato a pu prendre confiance en lui. Jiraiya décida donc de rentrer au Village de Konoha. Après cela il n’a plus eu de nouvelles de ses élèves, seulement des rumeurs les concernant… Maintenant Nagato et Konan sont adultes et retrouvent leur sensei après de nombreuses années, et leurs relations sont loin d’être amicales, car ceux-ci font maintenant partie de l’Akatsuki… Et au cours d’un terrible combat, Jiraiya fut tué par Pain, un mystérieux personnage possédant le Rinnegan de Nagato, ainsi que six corps dont celui de Yahiko…